山东新冠病毒基因测序能力全国第一 揭秘山东疾控“病毒猎人”:分离出多种变异株助力试剂研发

2022-05-09 07:05:19 来源:舜网-济南时报

作者:济南时报·新黄河客户端记者苏珊

责任编辑:鞠月芹

山东新冠病毒基因测序能力全国第一 揭秘山东疾控“病毒猎人”:分离出多种变异株助力试剂研发

  省疾控中心传染病防制所新冠病毒分离测序队的队员正在工作中

  这是一群与时间赛跑、与“看不见的敌人”较量的病毒侦探。

  他们有着孤勇者一般的“逆行勇气”,冒着感染风险,零距离接触病毒,以培养病毒毒株,为后期的疫苗研发、药物筛选打下基础。他们有着先进的侦查手段,在实验室对新冠病毒进行基因测序,追溯病毒源头,为流调专家追踪密切接触者打响“出发”的一枪,及时关上病毒传播的“潘多拉魔盒”。他们就是山东省疾控中心传染病防制所新冠病毒分离测序队的队员。作为一支平均年龄只有34岁的年轻团体,他们的青春之歌在抗击新冠肺炎疫情的战“疫”中奏响。

  “手握”病毒、“对视”病毒、“环绕”病毒……在山东省疾控中心生物安全三级实验室(BSL-3实验室),高度紧张的安静中,刘倜凝神静气开展着新冠病毒基因测序工作。作为山东省疾控中心传染病防制所副所长,他和同事们是离病毒最近的“病毒猎人”。从3月份我省出现本土新冠肺炎疫情以来,他和同事们已在抗疫一线持续战斗了两个多月。

  在新冠疫情发生之初,省疾控中心传染病防制所新冠病毒分离测序队却要“逆行而上”。“我们2020年2月8日开始开展病毒分离工作,面对病毒,说没有心理压力那是假的。当时一切都是未知,我们心里也会时常‘打鼓’,怕哪天不小心被感染了。但这是我们的本职工作,干事创业总要有人去干,我们的风险换来的是市民的平安。”刘倜说。

  BSL-3实验室是在负压状态,普通人在这种状态下可能会感到头晕乏力,甚至休克。但队员们不仅要长时间地待在实验室,而且必须全神贯注,因为一不留神,就可能影响结果,甚至造成实验室感染。同时,他们每天进入实验室需要进行生物安全三级个人防护:戴上N95口罩,穿上两到三层防护服,还要戴上几斤重的正压式呼吸器,防护服穿上后衣服很快就会湿透,每次实验过程至少需要4个小时,脱下防护服,堪比洗过一次“桑拿浴”。

  14名新冠病毒分离测序队队员都需要有一双“火眼金睛”。病毒需要在活的细胞上才能生长,将病毒接种好后,队员们需要一直盯着显微镜下的细胞细心观察。如果病毒进入细胞里面扩增了,细胞肯定会产生病变,表现就是细胞会胀大变圆。接种的每一个样本,他们都像照顾婴儿一样,每日悉心观察、检测、传代。即便自己的双眼已经盯显微镜盯得酸痛。

  目前,新冠病毒分离测序队已成功分离出多种变异毒株,为后续的新型冠状病毒抗病毒药物的筛选以及快速检测试剂的研发奠定了坚实的基础。团队还在继续对输入病例或本土病例开展病毒分离工作,同时利用分离到的病毒与我省的多个科研团队开展科研合作、药物筛选和试剂验证。由于卓越的技术支持工作,山东两家企业生产出新冠肺炎病毒抗原试剂,在国内占了一席之地。

  山东省疾控中心传染病防制所新冠病毒分离测序队队员的另外一项重要工作则是新冠病毒全基因测序。“基因测序就相当于为新冠病毒做了次亲子鉴定。”刘倜介绍,通过检测新冠病毒的全基因组序列,再将这个序列通过算法与数据库中的数据进行比对,可以初步判断该份样本地域来源。将序列与既往病例序列进行比对,如果序列在同一进化树分支上,则可以判断这些病例来自同一传播链或传染源。

  在本轮新冠肺炎疫情中,新冠病毒全基因测序像一支“奇兵”,成为阳性病例流调工作的有效补充,使得一桩桩疾病传播的“无头公案”慢慢捋出了头绪。济南市民都还记得,4月10日,济南市槐荫区报告1名核酸检测阳性人员,为在济南市儿童医院就诊人员入院筛查检测时发现。在流调中,孩子到底是在哪个环节被感染的最初一直是个谜题,正是新冠病毒基因测序的应用,队员们发现这例阳性无症状感染者病毒毒株基因测序为奥密克戎BA.2,与济南市建筑工地疫情首发病例同源。这使得后续的流调工作顺利进行,揪出了该病例染病的“真凶”。

  在山东省疾控中心传染病防制所的技术指导下,全省16市都已能独立开展新冠病毒全基因测序。目前山东新冠病毒基因测序能力在全国位居第一。

  若能护你岁月静好,疾控人甘愿负重前行。这真不是一句口号,而是包括山东省疾控中心传染病防制所新冠病毒分离测序队在内的全体疾控人正在日夜奋斗的原因。

作者:济南时报·新黄河客户端记者苏珊

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